So extrahieren Sie DNA aus jeder Zelle
Einfache DNA-Extraktion aus allem Lebenden
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DNS oder Desoxyribonukleinsäure ist das Molekül, das kodiert genetische Informationen in den meisten lebenden Organismen. Etwas Bakterien verwenden RNA für ihren genetischen Code, aber jeder andere lebende Organismus wird als DNA-Quelle für dieses Projekt dienen. Es ist einfach, DNA zu extrahieren und zu isolieren, die Sie dann für weitere Experimente verwenden können.
DNA-Extraktionsmaterialien
Während Sie jede DNA-Quelle verwenden können, funktionieren einige besonders gut. Erbsen, wie getrocknete grüne Erbsen, sind eine ausgezeichnete Wahl. Spinatblätter, Erdbeeren, Hühnerleber und Bananen sind weitere Optionen. Verwenden Sie aus ethischen Gründen keine DNA von lebenden Menschen oder Haustieren. Stellen Sie sicher, dass Ihre Probe tatsächlich viel DNA enthält. Alte Knochen oder Zähne oder Muscheln bestehen hauptsächlich aus Mineralien und nur Spuren von genetischem Material.
- 100 ml (1/2 Tasse) einer DNA-Quelle
- 1 ml (⅛ Teelöffel) Speisesalz, NaCl
- 200 ml (1 Tasse) kaltes Wasser
- Enzyme zu denaturieren Protein (z. B. Fleischklopfer, frischer Ananassaft oder Reinigungslösung für Kontaktlinsen)
- 30 ml (2 Esslöffel) flüssiges Geschirrspülmittel
- 70-90% Franzbranntwein oder anderer Isopropyl- oder Ethylalkohol
- Mixer
- Sieb
- Tasse oder Schale
- Reagenzgläser
- Strohhalme oder Holzspieße
Führen Sie die DNA-Extraktion durch
- Mischen Sie 100 ml DNA-Quelle, 1 ml Salz und 200 ml kaltes Wasser. Dies dauert etwa 15 Sekunden bei hoher Einstellung. Sie streben ein homogen suppige Mischung. Der Mixer bricht die Zellen auseinander und setzt die darin gespeicherte DNA frei.
- Gießen Sie die Flüssigkeit durch ein Sieb in einen anderen Behälter. Ihr Ziel ist es, die großen Feststoffpartikel zu entfernen. Halten Sie die Flüssigkeit; entsorgen Sie die Feststoffe.
- Fügen Sie der Flüssigkeit 30 ml Flüssigwaschmittel hinzu. Rühren oder schwenken Sie die Flüssigkeit, um sie zu mischen. Lassen Sie diese Lösung 5-10 Minuten einwirken, bevor Sie mit dem nächsten Schritt fortfahren.
- Geben Sie eine kleine Prise Fleischklopfer oder einen Spritzer Ananassaft oder Kontaktlinsenreinigerlösung in jedes Fläschchen oder Röhrchen. Schwenken Sie den Inhalt vorsichtig, um das Enzym einzuarbeiten. Starkes Rühren bricht die DNA und macht es schwieriger, sie im Behälter zu sehen.
- Kippen Sie jedes Röhrchen und gießen Sie Alkohol an der Seite jedes Glases oder Plastiks hinunter, um eine schwimmende Schicht auf der Flüssigkeit zu bilden. Alkohol hat eine geringere Dichte als Wasser, daher schwimmt er auf der Flüssigkeit, aber Sie möchten ihn nicht in die Röhrchen gießen, da er sich dann vermischt. Wenn Sie die Grenzfläche zwischen dem Alkohol und jeder Probe untersuchen, sollten Sie eine weiße, fadenförmige Masse sehen. Das ist die DNS!
- Verwenden Sie einen Holzspieß oder einen Strohhalm, um die DNA aus jedem Röhrchen einzufangen und zu sammeln. Sie können die DNA mit einem Mikroskop oder einer Lupe untersuchen oder sie in einen kleinen Behälter mit Alkohol geben, um sie aufzubewahren.
Wie es funktioniert
Der erste Schritt besteht darin, eine Quelle auszuwählen, die viel DNA enthält. Obwohl Sie verwenden können DNA von überall , Quellen mit hohem DNA-Gehalt ergeben am Ende mehr Produkt. Das menschliche Genom ist diploid , was bedeutet, dass es zwei Kopien jedes DNA-Moleküls enthält. Viele Pflanzen enthalten mehrere Kopien ihres genetischen Materials. Erdbeeren sind beispielsweise oktoploid und enthalten 8 Kopien jedes Chromosoms.
Durch das Mischen der Probe werden die Zellen auseinandergebrochen, sodass Sie die DNA von anderen Molekülen trennen können. Salz und Detergens dienen dazu, Proteine abzulösen, die normalerweise an DNA gebunden sind. Das Detergens trennt auch die Lipide (Fette) von der Probe. Die Enzyme werden verwendet, um die DNA zu schneiden. Warum willst du es schneiden? Die DNA ist gefaltet und um Proteine gewickelt, daher muss sie befreit werden, bevor sie isoliert werden kann.
Nachdem Sie diese Schritte abgeschlossen haben, wird die DNA von anderen Zellbestandteilen getrennt, aber Sie müssen sie noch aus der Lösung holen. Hier kommt der Alkohol ins Spiel. Die anderen Moleküle in der Probe lösen sich in Alkohol auf, DNA jedoch nicht. Wenn Sie Alkohol (je kälter, desto besser) auf die Lösung gießen, fällt das DNA-Molekül aus, sodass Sie es sammeln können.
Quellen
- Elkins, K.M. (2013). 'DNA-Extraktion'. Forensische DNA-Biologie . S. 39–52. doi:10.1016/B978-0-12-394585-3.00004-3. ISBN 9780123945853.
- Miller, DN; Bryant, J. E.; Madsen, E. L.; Ghiorse, W.C. (November 1999). 'Bewertung und Optimierung von DNA-Extraktions- und Reinigungsverfahren für Boden- und Sedimentproben'. Angewandte und Umweltmikrobiologie . 65 (11): 4715–24.